Законно, если решением суда место жительство детей будет определено с вами. В этом случае, супруг имеет право выписать вас и детей, как бывших членов семьи, утративших право пользования и проживания в квартире (ст.304 Гражданского кодекса РФ).

Но, пока вы не зарегистрируетесь по другому месту жительства, выписать детей будет нельзя. После вашей регистрации по другому месту жительства детей выпишут в соответствии со ст.20 ч.2 Гражданского кодекса РФ.